Bu iki uygulamanın kesiştiği birçok noktanın olduğunu öncelikle belirtmek gerekir. Yoga ve Plilatesi birbirinden ayıran en bariz fark ise yoga daha çok esneklik kazandırma, nefes kontrolü ve rahatlatmaya odaklanırken pilates güçlendirme, kas gelişimi ve dayanıklığı arttırmaya odaklanır. Hamilelik esnasında yapılan yoga ve pilates egzersizleri son derece kontrollü ve standart uygulamalara göre daha yavaş hareketlerden oluşur. Hareket temposu açısından bakıldığında hamilelere yaptırılan yoga hamile pilatesine göre daha yavaştır. Hamilelik pilatesi biraz daha tempolu ve seri hareketler içerir ve yoga dan farklı olarak pilates topu, pilates bantı gibi araçlar kullanıla bilir.